Wissenschaftlicher Mitarbeiter - Entwicklung, Anwendung und Evaluierung von Methoden der Hochdurchsatz-Metagenomik in Cloud-basierten Ausführungsumgebungen (w/m/d)
Ver: 103
Día de actualización: 04-10-2024
Ubicación: Bielefeld North Rhine-Westphalia
Categoría: Educación / Entrenamiento
Industria:
Contenido de trabajo
Die Abteilung Computational Metagenomics am Institut für Bio- und Geowissenschaften - Computergestützte Metagenomik (IBG-5) widmet sich bioinformatischen Forschungsaktivitäten mit dem Fokus auf die interdisziplinäre Entschlüsselung und Analyse von Meta-Genomen. Schwerpunkt ist insbesondere der Einsatz von Cloud-Technologien zur Analyse großer Datenmengen und zur Unterstützung verschiedener Anwendungen in den Lebenswissenschaften sowie der Biomedizin. Das IBG-5 integriert dabei sowohl auf nationaler (de.NBI), als auch auf internationaler Ebene (ELIXIR) Service- und Infrastrukturnetzwerke, um solche Datenanalysen sowohl für die wissenschaftliche Gemeinschaft als auch für den Endanwender effizienter und automatisierter zu gestalten.Ihre Aufgaben:
- Arbeit an einem breiten Spektrum von Methoden und Anwendungen der Metagenomik und des Cloud-Computing
- Verarbeitung, Analyse und Interpretation von Metagenomdaten verschiedener NGS-Plattformen (u.A. Illumina, ONT, PacBio) ihm Rahmen verschiedener Kooperationsprojekte
- Entwicklung von Analyse-Workflows unter Einbindung von Container- und Cloud-Technologien (z.B. Docker, Aptainer, S3, Openstack, Ansible)
- Unterstützung der Abteilung im Bereich administrativer Projektarbeit wie dem Verfassen von Anträgen und Berichten und der Teilnahme an Projekttreffen
- Unterstützung der Abteilung bei der Planung und Durchführung von Trainingskursen für Wissenschaftler unterschiedlicher Karrierestufen und Fachbereichen
- Veröffentlichung der wissenschaftlichen Ergebnisse in internationalen Fachzeitschriften und Reisen zu Konferenzen
- Austausch mit internen und externen Projektpartnern am IBG-5 und der Universität Bielefeld
Ihr Profil:
- Ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master) im Bereich der Bioinformatik, Informatik, Mathematik, Ingenieur-, Natur- oder Wirtschaftswissenschaften, oder eines verwandten Studiengangs mit anschließender abgeschlossener Promotion
- Erfahrungen an Big-Data-Analysen in Verbindung mit Cloud-Technologien und Workflows
- Gute Kenntnisse in der Sequenzanalyse und Metagenomik, insbesondere bei der Verarbeitung von Illumina und ONT Daten
- Sehr gute Programmierkenntnisse (z.B. in Python oder vergleichbar) und Kenntnisse relevanter Technologien (z.B. Git, Docker, Nextflow)
- Sehr sicherer Umgang mit Linux/Unix
- Fließende Englischkenntnisse in Wort und Schrift
- Hohes Maß an Selbstständigkeit und Bereitschaft sich in komplexe Themen einzuarbeiten
- Sehr zuverlässiger und gewissenhafter Arbeitsstil
- Gute Publikationsleistung
- Bereitschaft zur aktiven Wissensvermittlung, u.a. durch die Unterstützung bei der Planung und Durchführung von Trainingskursen
Unser Angebot:
Wir arbeiten an hochaktuellen gesellschaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Wir unterstützen Sie in Ihrer Arbeit durch:
- Hochinteressante, interdisziplinär angelegte, abwechslungsreiche Tätigkeit in einem hochaktuellen Themenkomplex
- Teilnahme an Projekttreffen und Konferenzen
- Starke Unterstützung und Mentoring für den Aufbau einer zukünftigen Karriere in der Wissenschaft und/oder der Industrie
- Weiterentwicklung Ihrer persönlichen Stärken, z. B. durch ein umfangreiches Trainingsangebot; ein strukturiertes Weiterbildungsprogramm und Vernetzungsmöglichkeiten speziell für Promovierende über JuDocS, das Jülicher Zentrum für Doktoranden und Betreuer: https://www.fz-juelich.de/judocs
- Optimale Voraussetzungen zur Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben sowie eine familienbewusste Unternehmenspolitik
- Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten, z. B. im Homeoffice, ist grundsätzlich nach Abstimmung und im Einklang mit den anstehenden Aufgaben und (Vorort-)Terminen gegeben
- Vermögenswirksame Leistungen und eine betriebliche Altersvorsorge
- Flexible Arbeitszeitmodelle sowie eine Vollzeittätigkeit, die auch vollzeitnah ausgeübt werden kann
Wir bieten Ihnen eine spannende und abwechslungsreiche Aufgabe in einem internationalen und interdisziplinären Arbeitsumfeld. Eine auf 2 Jahre befristete Stelle mit der Möglichkeit einer längerfristigen Perspektive. Vergütung und Sozialleistungen erfolgen in Abhängigkeit von den vorhandenen Qualifikationen und je nach Aufgabenübertragung im Bereich der Entgeltgruppe EG 13 nach dem Tarifvertrag des öffentlichen Dienstes (TVöD-Bund).
Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr: https://go.fzj.de/Benefits
Dienstort: Bielefeld
Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, z.B. hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.
Plazo: 18-11-2024
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